GST等の大分子量タグは対応できますか？

対応可能です。

直鎖プラスミドベクターへのライゲーション等を経ずに、Overlap Extension(Joining) PCRを用いて直接ORFにGST, Halo等のタグを付与可能です。詳細は、プロトコルセクションをご覧ください。